Op verzoek van staatsecretaris Huizinga van Verkeer en Waterstaat heeft TMIJ het Ontwikkelingsperspectief uit 2008 in 2009 verder uitgewerkt tot een Toekomstbeeld. Het resultaat, een uitgebreide studie naar de mogelijkheden van ecologische verbetering en de ontwikkelingsperspectieven op het gebied van recreatie, stadsontwikkeling en economie, is in september 2009 aangeboden aan het kabinet. In november 2009 heeft het kabinet besluiten genomen over alle projecten, waaronder TMIJ, die onderdeel uitmaken van RAAM (Rijksbesluiten Amsterdam - Almere - Markermeer).
Één van de besluiten van het kabinet is de realisatie van het in het Toekomstbeeld ontwikkelde Toekomstbestendig Ecologisch Systeem. De natuur in Markermeer-IJmeer moet weer tegen een stootje kunnen om de gevolgen van klimaatverandering en menselijk medegebruik op te kunnen vangen. Om dat doel te verwezenlijken wordt er een Werkmaatschappij Markermeer IJmeer opgericht.
De Werkmaatschappij Markermeer IJmeer bestaat uit de ministeries van I&M en EL&I en de provincies Noord-Holland en Flevoland. De WMIJ zet zich in om het Toekomstbeeld Markermeer-IJmeer in de context van de RAAM-brief nader uit te werken, te concretiseren en haalbaar te maken, zodat het in uitvoering genomen kan worden, steunend op een breed draagvlak in het perspectief van de duurzame ontwikkeling van de gehele regio.
Het Samenwerkingsverband TMIJ is als adviesgroep bij de Werkmaatschappij worden betrokken.